El centro se encuentra dentro del marco de la Secretaría General del SICA (SG-SICA) y se rige por las reglas y procedimientos institucionales. Las actividades del centro están plenamente integradas en la estructura energética regional y alineadas con sus normas y procedimientos. El centro colabora con la Unidad de Coordinación Energética de SG-SICA (UCE-SICA) y reporta al Consejo de Ministros de Energía de SICA.
La Estrategia Energética Sustentable 2030 de los países del SICA (EESCA 2030) constituye el instrumento regional marco del trabajo del SICREEE, tomando como base algunos de los objetivos específicos enunciados en la misma estrategia:
La estructura institucional del centro incluye:
El centro se rige por un Comité Ejecutivo (CE) y un Comité Técnico (CT) que se reunen al menos una vez y máximo dos veces al año. Por lo general, las reuniones de CE y CT se llevan a cabo de manera conjunta y coordinada con las reuniones regionales del Consejo de Ministros de Energía del SICA, cuyos miembros a su vez integran el CE.